Creada por el general José de San Martín en Pisco. Según la tradición, se inspiró en el vuelo de las parihuanas (flamencos de pecho blanco y alas rojas). Tenía líneas diagonales que formaban cuatro campos (rojos a los lados, blancos arriba y abajo) con un escudo central.

El marqués de Torre Tagle cambió el diseño por tres franjas horizontales (roja, blanca y roja) con un sol en el centro. La modificación se hizo porque el modelo anterior era muy complejo de confeccionar.

Torre Tagle volvió a modificarla para evitar confusiones en los campos de batalla con la bandera de España, que también tenía franjas horizontales. Se cambió la orientación de las franjas a verticales, manteniendo el sol central.

El Congreso Constituyente, bajo la dictadura de Simón Bolívar, fijó el diseño definitivo con las tres franjas verticales roja, blanca y roja, sustituyendo el sol del centro por el Escudo de Armas.

El presidente Manuel Odría decretó que la bandera civil de uso común se utilice sin el escudo en la franja central, reservando el diseño con escudo para el Pabellón Nacional usado por instituciones del Estado.